Esta excepción a mí me ocurrió cuando estaba intentando actualizar un registro de cuyo id no tenemos existencia en la base de datos, porque acababa de ser borrado.
org.hibernate.StaleStateException: Batch update returned unexpected row count from update [0]; actual row count: 0; expected: 1
at org.hibernate.jdbc.Expectations$BasicExpectation.checkBatched(Expectations.java:85)
at org.hibernate.jdbc.Expectations$BasicExpectation.verifyOutcome(Expectations.java:70)
at org.hibernate.jdbc.BatchingBatcher.checkRowCounts(BatchingBatcher.java:90)